Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UCHL3P15374 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms