Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB2P14652 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB2P14652 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB2P14652 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms