Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A1P13866 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A1P13866 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A1P13866 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A1P13866 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A1P13866 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC5A1P13866 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms