Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRP12270 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRP12270 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRP12270 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRP12270 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRP12270 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRP12270 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRP12270 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRP12270 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRP12270 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRP12270 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRP12270 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRP12270 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRP12270 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRP12270 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRP12270 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRP12270 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRP12270 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRP12270 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TPRP12270 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRP12270 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRP12270 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRP12270 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms