Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GNAT1P11488 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNAT1P11488 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNAT1P11488 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms