Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGF3P11487 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGF3P11487 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGF3P11487 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGF3P11487 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGF3P11487 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGF3P11487 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF3P11487 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGF3P11487 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF3P11487 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF3P11487 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms