Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDRP11473 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDRP11473 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDRP11473 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDRP11473 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VDRP11473 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VDRP11473 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VDRP11473 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDRP11473 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VDRP11473 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDRP11473 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDRP11473 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms