Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD8BP10966 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD8BP10966 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD8BP10966 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD8BP10966 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD8BP10966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD8BP10966 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8BP10966 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8BP10966 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD8BP10966 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD8BP10966 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD8BP10966 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD8BP10966 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms