Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPP1P10451 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPP1P10451 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPP1P10451 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPP1P10451 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPP1P10451 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPP1P10451 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPP1P10451 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPP1P10451 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms