Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV3-30-3P0DP02 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-3P0DP02 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-30-3P0DP02 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-30-3P0DP02 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms