Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC192P0DO97 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC192P0DO97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms