Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms