Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBBP0CG47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms