Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L7P0C7H9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L7P0C7H9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L7P0C7H9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L7P0C7H9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L7P0C7H9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms