Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB7P09629 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
HOXB7P09629 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms