Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFRBP09619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFRBP09619 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFRBP09619 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms