Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT7P08729 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT7P08729 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT7P08729 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT7P08729 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT7P08729 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT7P08729 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT7P08729 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT7P08729 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT7P08729 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT7P08729 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms