Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFICP08651 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFICP08651 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFICP08651 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFICP08651 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFICP08651 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFICP08651 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFICP08651 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFICP08651 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFICP08651 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms