Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRAP08240 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms