Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHBP07195 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHBP07195 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHBP07195 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHBP07195 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHBP07195 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHBP07195 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHBP07195 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHBP07195 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHBP07195 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHBP07195 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHBP07195 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHBP07195 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHBP07195 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHBP07195 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHBP07195 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHBP07195 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHBP07195 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHBP07195 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHBP07195 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHBP07195 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHBP07195 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHBP07195 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHBP07195 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms