Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGF1P05230 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGF1P05230 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGF1P05230 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGF1P05230 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGF1P05230 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGF1P05230 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGF1P05230 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGF1P05230 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGF1P05230 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGF1P05230 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGF1P05230 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGF1P05230 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGF1P05230 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms