Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOEP02649 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOEP02649 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOEP02649 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOEP02649 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOEP02649 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOEP02649 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOEP02649 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOEP02649 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOEP02649 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOEP02649 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOEP02649 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms