Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNB1P01574 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNB1P01574 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNB1P01574 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms