Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGPS1O95749 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGPS1O95749 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms