Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF12O95522 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF12O95522 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF12O95522 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms