Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG7O95352 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG7O95352 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG7O95352 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG7O95352 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG7O95352 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG7O95352 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG7O95352 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG7O95352 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG7O95352 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG7O95352 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG7O95352 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG7O95352 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG7O95352 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG7O95352 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG7O95352 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG7O95352 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG7O95352 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG7O95352 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG7O95352 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG7O95352 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG7O95352 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG7O95352 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms