Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB11O95342 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms