Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC31AO94979 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31AO94979 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms