Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG12O94817 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG12O94817 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG12O94817 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG12O94817 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG12O94817 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG12O94817 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG12O94817 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG12O94817 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG12O94817 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG12O94817 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG12O94817 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG12O94817 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG12O94817 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG12O94817 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms