Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT38O76015 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT38O76015 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT38O76015 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT38O76015 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT38O76015 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT38O76015 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT38O76015 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT38O76015 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT38O76015 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT38O76015 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT38O76015 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms