Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN15O75808 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN15O75808 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.4 ms