Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM3O75607 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM3O75607 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM3O75607 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM3O75607 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM3O75607 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM3O75607 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM3O75607 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM3O75607 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM3O75607 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM3O75607 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM3O75607 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM3O75607 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM3O75607 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM3O75607 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM3O75607 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM3O75607 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPM3O75607 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms