Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCATO75600 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCATO75600 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCATO75600 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCATO75600 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCATO75600 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCATO75600 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCATO75600 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCATO75600 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCATO75600 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCATO75600 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCATO75600 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCATO75600 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCATO75600 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms