Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP3O75386 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP3O75386 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP3O75386 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP3O75386 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP3O75386 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP3O75386 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP3O75386 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP3O75386 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP3O75386 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP3O75386 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP3O75386 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP3O75386 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP3O75386 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP3O75386 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP3O75386 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP3O75386 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP3O75386 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP3O75386 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms