Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA4O75335 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA4O75335 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms