Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA2O75334 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms