Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP3O75154 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB11FIP3O75154 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms