Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF40O75150 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF40O75150 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF40O75150 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RNF40O75150 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF40O75150 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF40O75150 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF40O75150 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF40O75150 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms