Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KERAO60938 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KERAO60938 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KERAO60938 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KERAO60938 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KERAO60938 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
KERAO60938 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KERAO60938 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KERAO60938 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KERAO60938 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KERAO60938 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KERAO60938 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KERAO60938 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KERAO60938 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KERAO60938 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KERAO60938 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KERAO60938 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms