Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX2O60749 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX2O60749 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX2O60749 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX2O60749 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX2O60749 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX2O60749 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX2O60749 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms