Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms