Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN1O60240 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN1O60240 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms