Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUDT21O43809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUDT21O43809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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