Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERI3O43414 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERI3O43414 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERI3O43414 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERI3O43414 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms