Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA3O43365 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA3O43365 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms