Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TREHO43280 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREHO43280 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREHO43280 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREHO43280 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TREHO43280 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREHO43280 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREHO43280 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREHO43280 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREHO43280 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREHO43280 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREHO43280 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREHO43280 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREHO43280 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREHO43280 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREHO43280 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms