Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS4O43181 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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NDUFS4O43181 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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NDUFS4O43181 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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NDUFS4O43181 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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NDUFS4O43181 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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NDUFS4O43181 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS4O43181 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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