Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CD3EAPO15446 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EAPO15446 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3EAPO15446 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms