Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2DO15399 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2DO15399 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms