Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1O15344 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1O15344 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1O15344 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MID1O15344 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MID1O15344 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MID1O15344 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MID1O15344 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MID1O15344 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MID1O15344 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MID1O15344 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MID1O15344 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MID1O15344 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MID1O15344 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MID1O15344 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MID1O15344 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MID1O15344 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MID1O15344 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MID1O15344 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms